Jeżeli pocjent zostanie zakfalifikowany do leczenia stosuje się zestaw kilku leków. Są to najczęściej dwa antybiotyki oraz inhibitor pompy protonowej lub metronidazol, antybiotyk i inhibitor pompy protonowej.

Najczęściej są stosowane:

antybiotyki

amoksycylina

klarytromycyna

chemioterapeutyki

metronidazol

inhibitory pompy protonowej (IPP)

omeprazol

pantoprazol

lanzoprazol

Celem leczenia jest eradykcja - czyli usunięcie zagnieżdżonej w błonie śluzowej żołądka bakterii. Eradykacja w wypadku choroby wrzodowej zapobiega nawrotom choroby i prowadzi do trwałego wyleczenia chorego.